Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCK3Q9BQ16 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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