Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
GJD4Q96KN9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms