Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms