Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms