Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms