Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL22A1Q8NFW1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL22A1Q8NFW1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL22A1Q8NFW1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL22A1Q8NFW1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL22A1Q8NFW1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL22A1Q8NFW1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL22A1Q8NFW1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL22A1Q8NFW1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL22A1Q8NFW1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL22A1Q8NFW1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL22A1Q8NFW1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL22A1Q8NFW1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL22A1Q8NFW1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL22A1Q8NFW1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL22A1Q8NFW1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL22A1Q8NFW1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL22A1Q8NFW1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC26■■□□□ 1.75
COL22A1Q8NFW1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC26■■□□□ 1.75
COL22A1Q8NFW1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
COL22A1Q8NFW1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
COL22A1Q8NFW1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL22A1Q8NFW1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
COL22A1Q8NFW1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26■■□□□ 1.75
COL22A1Q8NFW1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
COL22A1Q8NFW1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
COL22A1Q8NFW1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
COL22A1Q8NFW1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL22A1Q8NFW1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL22A1Q8NFW1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
COL22A1Q8NFW1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL22A1Q8NFW1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL22A1Q8NFW1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL22A1Q8NFW1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL22A1Q8NFW1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL22A1Q8NFW1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL22A1Q8NFW1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL22A1Q8NFW1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL22A1Q8NFW1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL22A1Q8NFW1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms