Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CRACR2BQ8N4Y2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CRACR2BQ8N4Y2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CRACR2BQ8N4Y2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CRACR2BQ8N4Y2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CRACR2BQ8N4Y2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CRACR2BQ8N4Y2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CRACR2BQ8N4Y2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRACR2BQ8N4Y2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms