Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFXL1Q6ZNB6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms