Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms