Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms