Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF544Q6NX49 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms