Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms