Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms