Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PROX2Q3B8N5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms