Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms