Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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