Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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LY6EQ16553 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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LY6EQ16553 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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LY6EQ16553 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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LY6EQ16553 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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LY6EQ16553 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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LY6EQ16553 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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LY6EQ16553 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LY6EQ16553 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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