Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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