Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRP1BQ14684 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRP1BQ14684 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP1BQ14684 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP1BQ14684 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP1BQ14684 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP1BQ14684 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP1BQ14684 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP1BQ14684 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP1BQ14684 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP1BQ14684 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP1BQ14684 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP1BQ14684 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP1BQ14684 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP1BQ14684 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP1BQ14684 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP1BQ14684 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP1BQ14684 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RRP1BQ14684 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RRP1BQ14684 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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