Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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