Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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