Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF1Q13351 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms