Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFIAQ12857 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms