Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms