Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms