Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms