Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms