Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBQ06643 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBQ06643 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBQ06643 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBQ06643 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBQ06643 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBQ06643 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBQ06643 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBQ06643 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBQ06643 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBQ06643 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBQ06643 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBQ06643 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBQ06643 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBQ06643 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBQ06643 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBQ06643 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBQ06643 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBQ06643 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBQ06643 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBQ06643 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBQ06643 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBQ06643 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBQ06643 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBQ06643 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBQ06643 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBQ06643 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBQ06643 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBQ06643 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBQ06643 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBQ06643 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBQ06643 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBQ06643 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBQ06643 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBQ06643 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBQ06643 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBQ06643 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBQ06643 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBQ06643 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBQ06643 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBQ06643 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBQ06643 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBQ06643 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBQ06643 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBQ06643 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBQ06643 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBQ06643 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBQ06643 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBQ06643 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBQ06643 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBQ06643 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBQ06643 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBQ06643 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBQ06643 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBQ06643 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBQ06643 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBQ06643 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBQ06643 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBQ06643 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBQ06643 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBQ06643 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBQ06643 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBQ06643 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBQ06643 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBQ06643 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBQ06643 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBQ06643 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBQ06643 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBQ06643 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBQ06643 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBQ06643 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBQ06643 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBQ06643 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBQ06643 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBQ06643 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBQ06643 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBQ06643 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBQ06643 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBQ06643 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBQ06643 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBQ06643 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBQ06643 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBQ06643 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBQ06643 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBQ06643 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBQ06643 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBQ06643 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBQ06643 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBQ06643 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBQ06643 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBQ06643 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBQ06643 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBQ06643 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBQ06643 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBQ06643 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBQ06643 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBQ06643 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBQ06643 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBQ06643 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBQ06643 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms