Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms