Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms