Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms