Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TMF1P82094 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TMF1P82094 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TMF1P82094 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TMF1P82094 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TMF1P82094 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TMF1P82094 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMF1P82094 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMF1P82094 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMF1P82094 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMF1P82094 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMF1P82094 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMF1P82094 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMF1P82094 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMF1P82094 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMF1P82094 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMF1P82094 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMF1P82094 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMF1P82094 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMF1P82094 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMF1P82094 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMF1P82094 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMF1P82094 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TMF1P82094 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMF1P82094 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMF1P82094 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMF1P82094 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TMF1P82094 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMF1P82094 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMF1P82094 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TMF1P82094 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMF1P82094 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMF1P82094 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TMF1P82094 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TMF1P82094 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMF1P82094 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMF1P82094 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMF1P82094 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMF1P82094 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMF1P82094 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMF1P82094 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMF1P82094 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMF1P82094 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMF1P82094 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMF1P82094 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMF1P82094 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMF1P82094 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMF1P82094 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMF1P82094 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMF1P82094 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TMF1P82094 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMF1P82094 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TMF1P82094 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMF1P82094 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMF1P82094 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMF1P82094 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMF1P82094 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMF1P82094 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMF1P82094 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMF1P82094 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMF1P82094 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TMF1P82094 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMF1P82094 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMF1P82094 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMF1P82094 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMF1P82094 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMF1P82094 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMF1P82094 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TMF1P82094 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMF1P82094 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMF1P82094 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMF1P82094 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMF1P82094 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMF1P82094 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMF1P82094 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMF1P82094 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMF1P82094 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMF1P82094 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMF1P82094 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMF1P82094 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMF1P82094 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMF1P82094 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMF1P82094 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMF1P82094 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMF1P82094 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TMF1P82094 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMF1P82094 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMF1P82094 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMF1P82094 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMF1P82094 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMF1P82094 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMF1P82094 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMF1P82094 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMF1P82094 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMF1P82094 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMF1P82094 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMF1P82094 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMF1P82094 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMF1P82094 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMF1P82094 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms