Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms