Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms