Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms