Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms