Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLNP26678 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLNP26678 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLNP26678 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLNP26678 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLNP26678 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLNP26678 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLNP26678 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLNP26678 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLNP26678 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLNP26678 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLNP26678 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLNP26678 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLNP26678 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLNP26678 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLNP26678 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLNP26678 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLNP26678 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLNP26678 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLNP26678 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLNP26678 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLNP26678 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLNP26678 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLNP26678 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLNP26678 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLNP26678 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLNP26678 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLNP26678 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLNP26678 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLNP26678 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLNP26678 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLNP26678 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLNP26678 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLNP26678 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLNP26678 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PLNP26678 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLNP26678 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLNP26678 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLNP26678 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLNP26678 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLNP26678 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLNP26678 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLNP26678 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLNP26678 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLNP26678 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLNP26678 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLNP26678 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLNP26678 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLNP26678 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLNP26678 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLNP26678 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLNP26678 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLNP26678 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLNP26678 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLNP26678 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLNP26678 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PLNP26678 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLNP26678 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLNP26678 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLNP26678 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms