Protein–RNA interactions for Protein: P23435

CBLN1, Cerebellin-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN1P23435 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBLN1P23435 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms