Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALB2P22676 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALB2P22676 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALB2P22676 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALB2P22676 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALB2P22676 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALB2P22676 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALB2P22676 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALB2P22676 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALB2P22676 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALB2P22676 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALB2P22676 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CALB2P22676 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CALB2P22676 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALB2P22676 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALB2P22676 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALB2P22676 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALB2P22676 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALB2P22676 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALB2P22676 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALB2P22676 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALB2P22676 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALB2P22676 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALB2P22676 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALB2P22676 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALB2P22676 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALB2P22676 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALB2P22676 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALB2P22676 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALB2P22676 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALB2P22676 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALB2P22676 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALB2P22676 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALB2P22676 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALB2P22676 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALB2P22676 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALB2P22676 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALB2P22676 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALB2P22676 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALB2P22676 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALB2P22676 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALB2P22676 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALB2P22676 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALB2P22676 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CALB2P22676 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALB2P22676 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALB2P22676 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALB2P22676 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALB2P22676 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALB2P22676 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CALB2P22676 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALB2P22676 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALB2P22676 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALB2P22676 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALB2P22676 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALB2P22676 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALB2P22676 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALB2P22676 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALB2P22676 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALB2P22676 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms