Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNSO60931 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNSO60931 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNSO60931 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNSO60931 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNSO60931 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNSO60931 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNSO60931 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNSO60931 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNSO60931 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNSO60931 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNSO60931 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNSO60931 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNSO60931 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNSO60931 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNSO60931 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNSO60931 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNSO60931 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNSO60931 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNSO60931 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNSO60931 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNSO60931 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNSO60931 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNSO60931 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNSO60931 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNSO60931 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNSO60931 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNSO60931 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNSO60931 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNSO60931 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNSO60931 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNSO60931 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNSO60931 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNSO60931 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNSO60931 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNSO60931 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNSO60931 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNSO60931 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNSO60931 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNSO60931 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNSO60931 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNSO60931 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNSO60931 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNSO60931 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNSO60931 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNSO60931 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNSO60931 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNSO60931 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNSO60931 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNSO60931 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNSO60931 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNSO60931 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNSO60931 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNSO60931 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNSO60931 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNSO60931 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNSO60931 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNSO60931 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNSO60931 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNSO60931 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNSO60931 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNSO60931 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNSO60931 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNSO60931 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNSO60931 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNSO60931 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNSO60931 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNSO60931 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNSO60931 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNSO60931 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNSO60931 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNSO60931 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNSO60931 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CTNSO60931 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNSO60931 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNSO60931 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNSO60931 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNSO60931 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNSO60931 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNSO60931 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNSO60931 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNSO60931 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNSO60931 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNSO60931 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNSO60931 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNSO60931 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNSO60931 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNSO60931 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNSO60931 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNSO60931 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNSO60931 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNSO60931 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNSO60931 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNSO60931 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNSO60931 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNSO60931 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNSO60931 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNSO60931 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNSO60931 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNSO60931 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms