Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms