Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR5

KRTAP4-2, Keratin-associated protein 4-2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-2Q9BYR5 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CCBE1-202ENST00000439986 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ASPH-201ENST00000356457 3730 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC12A6-207ENST00000558667 3725 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 AC009108.4-201ENST00000623284 2451 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 GDNF-208ENST00000620847 3638 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 MBL2-201ENST00000373968 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CHST15-205ENST00000628426 3553 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SNTG1-207ENST00000522124 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PAQR5-205ENST00000561153 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PCDHGA8-201ENST00000398604 4605 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 DIRAS1-201ENST00000323469 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PIWIL2-202ENST00000454009 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 DPP3-205ENST00000530165 2251 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 TTLL13P-206ENST00000641754 2256 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 AL442125.1-201ENST00000619092 3362 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 MYO7B-203ENST00000428314 6715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SCN4B-201ENST00000324727 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 DAG1-218ENST00000515359 5576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 AC004241.1-201ENST00000547799 3299 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 TCN2-205ENST00000450638 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 APPL2-213ENST00000551662 2190 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 TGOLN2-202ENST00000377386 6489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ARMC2-203ENST00000392644 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 MYO18A-209ENST00000531253 7504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 HDAC7-230ENST00000552960 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 MRPS33-201ENST00000324787 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 NSD3-203ENST00000433384 5276 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 UBE2D3-209ENST00000394804 4166 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 AC087164.2-201ENST00000624514 3130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SORBS2-231ENST00000449407 3049 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ST3GAL1-207ENST00000521180 6951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 KLHL38-201ENST00000325995 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 KCNQ3-201ENST00000388996 11510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 LIFR-AS1-201ENST00000500733 3803 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 RCAN1-207ENST00000481448 2816 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 GOLGA8DP-201ENST00000314246 2786 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PCDHGC4-203ENST00000617094 2793 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 DOCK6-201ENST00000294618 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 DIDO1-202ENST00000354665 2707 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 HHAT-202ENST00000367009 2714 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 BAHD1-201ENST00000416165 4526 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ATP7B-203ENST00000400366 6304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC00461-212ENST00000511014 3539 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ERCC5-201ENST00000355739 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 TMEM246-202ENST00000374848 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 TP53I11-203ENST00000395648 3381 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 RAB43-205ENST00000393308 4193 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 FGD3-202ENST00000375482 3321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 KDM8-201ENST00000286096 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ARHGEF2-203ENST00000361247 4149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ITIH1-211ENST00000537050 2493 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SUN2-202ENST00000405510 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC22A8-210ENST00000545207 1622 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 GALNT15-203ENST00000437509 2416 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 MARCH10-209ENST00000583600 3214 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM225B-201ENST00000423546 5629 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 GBA-201ENST00000327247 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 MYO1C-202ENST00000361007 4734 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CELF2-202ENST00000399850 7085 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.4 ms