Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms