Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms