Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms