Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MED23Q9ULK4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms