Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
IFNKQ9P0W0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms