Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms