Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRMT1Q9NXH9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms