Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms